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1、由于A-T/C-G配对时，两个核糖磷酸连接的碱基的主轴并不成180°，因此DNA在磷酸骨架距离较近的一侧形成小沟，而对侧形成大沟。
2、这是双螺旋大、小沟的结构成因。
3、在功能方面，大、小沟（ major and minor grooves）中分别有很多功能基团暴露在侧，因此大、小沟在DNA与蛋白质相互作用（protein-DNA interaction）中起到了关键的作用，如引发甲基化作用等，结合转录因子等。
4、二者的区别就在于二者内部蕴含的结合位点的差别，从而引发不同蛋白的结合以及不同的生化反应。
5、总而言之，看似由轴不对称引发的现象在背后拥有着重大的分子功能和演化机制。
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